▲段祺瑞执政府旧址
后来，段祺瑞任国府总理。1926年3月18日上午10时，..与学生联合会等团体共约5000多人在京举行“反对八国最后通牒的国民大会”。..中，现场负责人员担心局势失控，命令预伏军警以武力驱散..队伍，结果造成当场死亡47人，伤200多人的惨剧。段祺瑞在得知政府卫队打死徒手请愿的人们之后，匆忙赶到现场，面对死去的学生和市民，却长跪半日不起。
次日自己向国会主动提出引咎辞职，表示从此再不过问政事，并从此终生食素，以示忏悔，一个月后国会接受辞职，从此段过起了隐居生活。
█ 段祺瑞的人格魅力
人们可以从生平﹑学业﹑政治﹑为人处世﹑晚年评价等方面，领略到段祺瑞的人格魅力。
▲段祺瑞
◆ 攻业颇勤敏
青年段祺瑞以“攻业颇勤敏，以力学不倦见称于当时，治学既专，每届学校试验，辄冠其侪辈，与王世珍等齐名于世”。同时还以第一名的成绩被获准与其他四位同学到德国留学，官费入柏林学校学习。每一个成功背后的秘诀总少不了勤敏与奋斗，段祺瑞这种积极进取不甘落后的学习精神值得每一个求学者效仿。
◆ 三造共和
在政治成就方面，段祺瑞拥有“三造共和”的美誉。1908年11月，慈禧和光绪相继病死，摄政王载沣欲杀袁世凯，段祺瑞制造假兵变，使载沣不敢动手。1912年1月26日，段祺瑞秉承袁世凯意旨联名46名北洋高级将领电促清廷退位。1915年1月18日..向袁世凯提出二十一条”，段等致电北洋政府表示反对，袁世凯召开对日会议时段祺瑞主张强硬，袁世凯最终没有在条约上签字。1917年6月14日张勋复辟，段祺瑞讨伐张勋，使其复辟的美梦破灭。这三件事可以充分证明，段祺瑞在维护国家共和方面是功不可没的。
◆ 长跪赎罪
对于在1926年3月18日发生的“三一八惨案”，也不应该完全归咎于段祺瑞。诚然，作为最高军政长官，对这种悲剧的发生具有不可推卸的责任，但他随即赶至现场，向死者长跪不起，并决定终身食素，至死都没有违背。可见段祺瑞并不是一个冷血的首领，在他看来生命并不是能够随意践踏蹂躏的，并且他始终恪守着自己的道德准则。
◆知恩图报
段祺瑞是一个知恩图报的人：为报袁世凯的知遇之恩，段祺瑞这位曾逼帝去位，拥立袁氏的关键人物，坚决反袁称帝，一再陈情“此事危及国家安危和袁家的身家性命，万不可做，万不能做。”正是因为对袁世凯怀有深深地感激之情，才会不顾一切如此恳切地奉劝的恩人不做历史的罪人。
▲段祺瑞
