虽然美军核潜艇的战斗力和隐蔽性相当强大，但意外与丑闻一直伴随着他们。2018年1月美国《海军时报》网站报道称：在“弗吉尼亚”级“北达科他”号的攻击型核潜艇的海底巡航途中，一名士官使用一把手枪向自己胸口开枪，自杀未遂的他被医生救治。导航人员在狂风巨浪中克服困难上浮返航回到海军基地，将该士官送医救治，最终挽救了他的生命。
潜水艇因其特殊的任务使命，造就了战斗隐蔽性和工作长期性的特点。漫长枯燥的任务让许多男人都难以接受，所以大部分国家的海军都严令女兵禁止登艇。美国在2010年10月正式取消了女兵在潜艇中服役的禁令，随后有几十名女兵去到潜艇服役。由于潜艇空间狭窄资源有限，洗浴间都是男女共用，这就给了不安分士兵惹是生非的机会。2014年12月又是《海军时报》曝出：“怀俄明”号核动力弹道导弹潜艇的女兵在洗澡时，被安装在浴室的针孔摄像头偷拍，时间长达1年。嫌疑人是一名年仅24岁的二级军士官，他还将所得视频传播给其他男兵们观看，最终事情败露。
除性丑闻外，还有其他恶性事件的发生。2017年10月18日美国CNN报道：乔治亚州金斯湾海军潜艇基地的两名水兵死亡，原因都是吸毒。10月12日，一名25岁的水兵死在基地住处外，死因是吸毒过量。10月16日，又有一名 “俄亥俄”级战略核潜艇的二等士官迪·贝尔，在沙发上口吐白沫，同样吸毒过量的他也很快死去。接连两起吸毒事件后，金斯湾基地如临大敌，组织所有现役人员尿检。
2011年还有核潜艇上发生过，在专业技能考核时水兵集体作弊的丑闻，实在令美军脸上无光。平日里总叫嚣着亮王牌秀肌肉的美国海军，却总是后院起火，自己打自己的脸，真是嘲讽至极。军方是时候停止去世界挑衅，而好好整治下内部的作风纪律了。
