医院各学科建设进展突出，是国家卫生部批准的上海首批生殖医学中心和首批四级妇科内窥镜手术..基地，同时成为国家卫计委首批准入的高通量测序PGD（植入前遗传诊断）和NIPT（无创产前筛查）临床应用试点单位。诞生了上海市首例全基因组筛查 PGS（移植前遗传筛查） 健康婴儿、国内首例单细胞高通量测序联合核型定位的甲状腺癌家系 “无癌”PGD婴儿，以及国际首例基于NGS（高通量测序）的SNP（单核苷酸多态性）单体型分型PGD技术阻断成骨不全症母婴遗传的健康婴儿等。
在转化医学领域，国妇婴也取得了诸多重要成果，例如，将国际最新基因诊断技术成功转化应用于临床，，在产前和孕前基因诊断技术上处于国内领先地位，多例基因诊断健康婴儿诞生。上海市生殖医学重点实验室—胚胎源性疾病临床医学基地落户医院；成立上海交通大学医学院胚胎源性疾病研究所并通过考核；围产科作为参与单位列入上海市第四轮公共卫生三年行动计划——重点学科建设；顺利完成交大医学院临床潜力学科（围产医学）第二期建设；儿科学-新生儿方向参与上海市薄弱学科项目。
医院的高层次人才工作引进与培养并重，屡屡实现新突破，目前拥有中国科学院院士、英国皇家妇产科学院荣誉院士、国家 “973”重大科学研究计划首席科学家、国家 “十二五”国家科技支撑计划项目牵头人、国家“863”计划重大项目负责人、国家自然科学基金重大研究计划课题负责人、国家自然科学基金重大国际合作项目负责人、国家重点研发计划项目负责人、国家杰出青年科学基金获得者、中组部青年..人才项目获得者等多名高层次人才，同时，还邀请海外知名院士、教授和学者担任医院特聘专家。
国妇婴注重开展国际交流合作，国际影响力和竞争力稳步提升。合作建立的上海交通大学—香港中文大学人类生殖及相关疾病联合研究中心获得全国妇幼健康科学科技成果一等奖，完成国家 “973”项目，并在 《自然·医药》 《美国科学院院刊》 《临床内分泌代谢》等杂志上发表学术论文。
