1645年6月唐王朱聿键在福建称帝是为隆武政权。1646年3月郑芝龙出卖隆武帝，隆武帝逃到江西被清军所捉，绝食而亡。跟着隆武帝的被俘绝食而亡，南明的形势日就衰败，南明的疆域已经缩小到剩下四川、湖广和云贵一隅之地。
南明小朝廷官员眼前摆放了一个急迫的问题，就是谁来做南明小朝廷的皇帝？
两广还真有合适的人选，就是万历皇帝的孙子、桂王朱由榔，他是明神宗朱翊钧之孙，明光宗朱常洛之侄，桂端王朱常瀛之子。1623年，朱由榔生于北京顺天府，1646年袭封桂王。
桂王一系原封湖南衡州，崇祯十六年因张献忠兵祸而逃亡广西梧州。之后，朱由榔的父兄先后作古，朱由榔继续了桂王爵位，后隆武帝被俘，桂王被拥立为帝，是为永历帝，也是广义明朝的最后一位皇帝。
1646年永历政权竖立之时，在明朝灯号下的各类势力还掌握着中国西南的恢弘地区，而且在中国东南沿海的一些处所（稀奇是台海区域）也处于强势地位。
大西军的首领张献忠在四川被清军击毙，大西军余部在四上将领孙可望、李定国、刘文秀、艾能奇率领下进入云南，和明朝在云南的最高统治者——世守云南的黔国公沐天波杀青和谈，决意共扶明朝皇室后人，配合恢复大明山河。
李自成大顺军的余部也活跃在湖北，把在那边的清朝官员一切杀掉。一时之间形势大好，各地反清势力的共主就是永历皇帝。
清朝的两广提督李成栋在广东也公布反清归明，领兵北攻赣州。明军乘隙抨击湖南，到11月，清兵仅保有长沙﹑岳阳两城罢了。
清朝的大同总兵姜瓖公布反清，反清运动扩展到北方。在东南沿海，忠于南明的郑成功4月攻占福建同安，竖立凭据地。
安南黎氏政权也应永历政权的恳求，于1647年夏派出三百艘战船进逼广东廉州，匡助抗击清军。
郑成功集体是明朝消亡之后东亚世界独一可以对清朝组成重大威胁的力量。郑成功的海上力量在整个东亚世界是第一，其时世界的海上霸王荷兰被他打败后，都要向他上供。
郑成功看北伐无望，才转向..，把荷兰打得大北，竣事了荷兰人对..区域的统治，收复了..，郑氏武装是一支很壮大的力量。
因为永历帝的能力太差，基本无法统率这些有利的搞清力量，再加上因为孙可望挑起的内讧，永历政权和明朝注定弗成能翻身了。
1659年闰正月，永历帝和文武官员在清军的紧逼下已经退到了中缅边境，在清军的压力下，永历帝做了一个错误的决意，南明文官官员和两千多戎行“尽释甲仗”，进入缅甸境内，成了毫无自立能力的遁迹政权。
1661年，吴三桂戎行攻入云南，强制缅甸交出永历帝。缅甸此时无力抵当清军，只好引渡永历，以换取清军撤兵。缅甸人在咒水这个处所把永历帝抓了起来，被称为“咒水之难”。
永历帝给吴三桂写了一封信，永历帝的悲鸣并没有获得吴三桂的丝毫同情，缅王将永历君臣交给吴三桂。1662年四月二十五日，永历帝被吴三桂命人用弓弦勒死在小庙之中。
