慈禧身后，她的尸体在长达76年的时间里，先后三次殓入统一口棺内。
第一次入棺光绪三十四年(1908年)十月二十二日，慈禧走完了她74年的人生旅程，撒手人寰。当世界午，掌仪司首领寺人用鹅黄祥瑞轿将慈禧的尸体从西苑仪銮殿抬出。第二天上午，在隆裕皇太后和瑾妃的敬视下，将慈禧的尸体殓入了棺内。宣统元年(1909年)十月初四日，慈禧的梓棺葬入菩陀峪定东陵地宫。
第二次入棺1928年7月4日至10日，军阀孙殿英盗掘了乾隆帝的裕陵和慈禧陵，毁棺抛尸，掠走了悉数随葬至宝。慈禧尸体被抛出棺外，嘴里的宝珠被抠走。盗案发生后，溥仪派载泽、耆龄等人到东陵进行了从新埋葬。载泽等人钻进地宫，见慈禧尸体趴在椁盖上，在地宫里已暴尸40多天，尸体上显现了很多黑点，长了很多白毛。载泽等人见内棺尚无缺，于是命旗妇用一块黄绸子将慈禧尸体盖上，将一件黄缎褥铺在尸体一侧，然后翻转尸身，将尸体仰卧到黄缎褥上。世人帮用如意板将慈禧尸体抬入棺内。尸体上盖上一件黄缎被，把从地宫里拾到的慈禧生前剪下的指甲和掉的牙用黄绸子包好，放在被上。载泽又将昔时获得的慈禧遗物———一件黄缎袍、一件坎肩盖在被上，盖上棺盖，用漆封上棺口，重殓完毕。
第三次入棺1983年12月初，清东陵文物保管所决意清理慈禧内棺。1984年1月4日，国度文物局派来了几名专家，与清东陵文物保管所构成了一个清理慈禧内棺10人小组。第二天，清理小组依次揭取了被上的两件衣服，发现了包着慈禧指甲和牙齿的小黄包。当将黄缎被卷走后，慈禧的遗骸呈如今面前。尸体仰身直卧着，头微微左偏，右手放在腹部，左臂天然地垂于身体左侧。尸体全长153厘米。清理小组用她身底下的如意板将尸体从棺中抬出，放在地宫的地面上。在棺内喷洒了防腐消毒药液后，将慈禧的尸体抬入棺内。这是她身后第三次被抬入这口棺中。然后将被、小黄包等物完全按原递次、原位置放回。一切恢复原状后，又往棺内喷洒了一遍药液，盖上棺盖，封好棺盖口，木匠们将残缺的外椁修好后，套在了棺外。现在，慈禧的尸体仍完整地躺在棺内，保留着1928年重殓时的状况。
