1856年（清咸丰六年）7月9日，黄飞鸿出生于广东省南海县，其父黄麒英乃晚清有名武师，“广东十虎”之一，技艺高强，长于治疗跌打伤害。但黄麒英家中贫穷破落，只能靠卖艺将就过活。黄飞鸿三岁起随父亲学武，习得虎拳、鹤拳。但黄麒英并不进展儿子像本身一般，靠着技艺维持生计，过贫困落魄的生活，而是指望他有朝一日能考取功名，于是将卖艺得来的蓄积供给黄飞鸿读书之用。但黄飞鸿对读书全无乐趣，反而对父亲传给他的武功分外上心，甚至不吝逃学，在路边偷偷旁观父亲卖艺。黄麒英得知黄飞鸿逃学的事后十分生气，可是黄飞鸿执意不愿读书，要与父亲一路卖艺走江湖，黄麒英也只得赞成了。黄飞鸿学武的天份很高，好多招式往往学一遍就会了。到了黄飞鸿七八岁的时候，他正式起头追随父亲闯荡江湖，靠卖艺行医为生。
1924年（民国十三年）10月，广州国民当局镇压商团暴动，西关一带衡宇被毁，仁安街“宝芝林”也受累被焚，所有资财付于一炬，长子又告失业，黄飞鸿郁闷成疾
1925年（民国十四年）4月17日，黄飞鸿病逝于广州城西轻易病院，终年69岁。因贫无立锥无力殡葬，由女门生邓秀琼出资互助，埋葬在白云山麓。
