在第二次世界大战爆发之前，阿根廷与西班牙、意大利和德国有着密切联系。二战爆发后，西班牙、意大利和德国成为轴心国，阿根廷曾被西班牙殖民，阿根廷的国家通用语言也是西班牙语。当第二次世界大战开始时，阿根廷虽然属于中立国，但举国上下对轴心国给予巨大的支持。原因有二：一是阿根廷与轴心国有较深的历史渊源，二是阿根廷同样反犹太。
犹太人在阿根廷建设中作用很大，第二次世界大战开始前，这些犹太人同样遭到阿根廷人的迫害。纳粹大屠杀期间，阿根廷拒绝犹太人逃亡到他们国家，但仍有少量的犹太人通过贿赂官僚进入阿根廷。
图：1948年3月，佩隆总统（右）签署关于英国铁路..的协议。
阿根廷还利用其中立地位，帮助轴心国说话。1944年，在美国的巨大压力下，阿根廷不得不中断与德国的关系，在战争结束前一个月才加入盟国。这在外界看来是非常正确的选择，但胡安·佩隆却私下对人说，“这一切都是为了表演给美国人看”。
1945年，德国投降后，多数阿根廷人非常悲愤，对逃亡到阿根廷的德国战犯庇护有加。总统佩隆积极协助德国战犯逃到阿根廷，他派特工到欧洲给战犯提供资金，协助逃亡。德国战犯逃到阿根廷，佩隆还常常接见他们。
佩隆认为，这些逃犯会很有用。第二次世界大战结束时，他预测1949年美苏两大阵营会发生第三次世界大战，阿根廷仍然可以成为中立国，届时德国战犯会很有价值，因为他们训练有素，，而且强烈反美亦反苏，可以成为他参与博弈的重要棋子。所以，他千方百计为逃到阿根廷的德国战犯予以保护，对纽伦堡审判“表示愤怒”。
1955年，这个自以为聪明的总统被推翻后流亡，近20年后才重新回到阿根廷。佩隆的垮台，让阿根廷的德国战犯失去了靠山，纷纷逃到附近的南美国家避难，当然也有不少德国战犯留在阿根廷，融入了当地。德国与阿根廷之间也因这段经历，多了复杂的情感。
