现代战争中，轰炸机最害怕的是导弹袭击，所以现代轰炸机没有直接进入战场执行投射任务，但是轰炸机作为一种廉价的导弹发射..，还是特别需要的，例如，美军的B-52战略轰炸机可以装载20枚巡航导弹，虽说跟一艘核潜艇能携带24枚导弹相比差了不少，但是B-52能够具有快速、远距离抵达战场执行作战的能力，而且空射巡航导弹比潜射导弹造价便宜了一半多，故此轰炸机的功能不可替代。
由于轰炸机飞得很高，普通的肩扛式导弹不能达到那样的高度，而轰炸机一般只有在地面基本丧失了防空力量后才会进入战场，故此轰炸机不是那么容易被击落的。但其实，所有的飞机都害怕防空导弹，但导弹是死的，人是活的，如何作战取决于如何使用这些武器。
自从飞机进入战场以来，空袭和防空一直是空战的两个要素。此后,地面防空导弹是现代防空的主力装备, 对于今天的战术和战略轰炸机是主要的威胁。现代的飞机配备了各种红外干扰弹、箔条干扰弹，还有拖尾式诱饵，机身内部的ECM电子作战设备，也能有效干扰防空导弹目标。与此同时，在轰炸机小组抵达战场之前，通常是在已方已经对敌方的防空导弹进行了压制，以确保加强任务的安全。并且，隐形能力和防御区域外攻击能力也是未来轰炸机的发展重点，最大限度地提高空袭的偶然性。
