刺客信条1故事设定在欧洲中古黑暗的十字军东征时期，，游戏舞台穿梭于大马士革、耶路撒冷等中东历史名城之间，玩家扮演刺客组织年轻有为的刺客阿泰尔（下图白袍）。
刺客信条2分为三部作品：2、兄弟会、启示录。故事设定在文艺复兴时期的意大利，玩家扮演游戏史上传奇角色艾吉奥.奥迪托雷（下图），从年轻时候一直到中年，再到老年一直扮演艾吉奥，在佛罗伦萨、威尼斯、罗马、君士坦丁堡之间旅行，从为家族报仇到重振衰落的刺客组织再到寻找信条真谛，育碧用三部作品塑造了一个游戏史上难以超越的角色，用艾吉奥传奇的一生告诉玩家什么叫做信条！
刺客信条3故事设定在美国独立战争时期，主角有两位，圣殿骑士大师海尔森以及刺客康纳（下图），两者系父子关系。游戏前期扮演年轻的海尔森，来到北美打击刺客组织，根除传统的顽固势力，在这个殖民的过程中，他与当地土著女性相爱一夜情之后生下一子名为康纳。游戏中后期扮演康纳，康纳少年时目睹圣殿骑士的部队侵略了自己的村庄，屠戮自己的伙伴亲人，自己的母亲也死于这场侵略，在一名老刺客的指引下从此踏上了对抗圣殿骑士的道路，最终不得不手刃自己的生父海尔森，故事的结尾康纳已经失去了太多，血与泪的故事也在历史的车轮中被碾碎被遗忘。
