1908年11月14日傍晚，光绪皇帝驾崩，时年37岁；第二天下午，慈禧太后也断了气。37岁的光绪死在74岁的慈禧前面，而且仅隔一天，引起许多猜测。有人认为，慈禧不愿意光绪在自己死后重新掌权，派人毒死了光绪。有人说，戊戌变法时袁世凯出卖光绪，怕慈禧死后遭光绪报复，于是贿赂太监下毒。还有说是太监李莲英下的毒，因为他得悉光绪日记中说慈禧死后将诛袁世凯和他。但也有人认为光绪是身体虚弱病死的。
光绪皇帝
众说纷纭的光绪死因疑案，终于在这位可怜的皇帝百年忌日到来之际有了科学的结论——光绪死于砒霜中毒。2008年11月，国家清史工程编纂..在北京举行了“清光绪皇帝死因报告会”，公布一份采用现代刑侦和高科技手段检测的1万字报告。
2008年11月，清西陵文物管理处、中国原子能研究院反应堆工程研究设计所、北京市公安局法医鉴定中心先后提取了光绪分别长26厘米、65厘米的两小缕头发，清洗后晾干，剪成1厘米长的截段，逐一编号、称重和封装，然后用核分析方法逐段检测光绪头发中的元素含量。
清崇陵
结果显示，光绪头发中含有高浓度的元素砷，且各截段含量差异很大，第1缕头发的砷高峰值出现在第10段(2404微克/克)，第2缕头发的砷高峰值出现在第26段(362.7微克/克)和第45段(202.1微克/克)。而同时对比测试的头发砷含量，当代人为0.14至0.59微克/克，与光绪同时代并埋在一起的隆裕皇后为9.20微克/克，清末一个草料官干尸头发为18.2微克/克。
慈禧太后
检测部门又按照规范的法医检验要求和方法，提取了光绪遗骨及衣物样品测试，结果肩胛骨、脊椎骨和每件衣物的胃区部位、系带和领肩部位的含砷量很高；内层衣物的含砷量大大高于外层。再对光绪棺椁内、墓内物品和陵区水土等进行对比实验，结果表明光绪头发上的高浓度砷物质并非来自环境沾染。
清崇陵
最后他们得出结论:光绪头发上的高含量砷并非为慢性中毒自然代谢产生，而是来自于外部沾染；大量的砷化合物曾存留于光绪尸体的胃腹部，尸体腐败过程进行再分布，侵蚀了遗骨、头发和衣物。而砷化合物也就是剧毒的砒霜。经过科学测算，光绪摄入体内的砒霜总量明显大于致死量。
清崇陵明楼
1980年6月，清西陵文物管理处曾对光绪及隆裕皇后的棺椁(曾于上世纪30年代末被盗)进行清理并重新封闭，两人的头发被移至棺椁外面，保管在清西陵库房里。这次清理崇陵地宫，发现光绪皇帝的尸身虽然已经没有肌肉，但骨骼各关节还都连接完好，一米六四的身躯，没有刀剁斧砍的痕迹。那次清理崇陵地宫时，确曾对光绪的头发和尸骨进行了化验，但当时条件很有限，检测化验是在县城医院及防疫站进行的，没有查出什么结果，没有发现光绪中毒的迹象。
清崇陵地宫
