朱温投入了起义军。在平常生活中到处被人不齿的朱温，换了玩命的环境，却得到了用武之地，他作战勇敢，每一仗都冲在前头，因功被提升为队长。
黄巢自称冲天大将军，朱存随黄巢率兵南下，而朱温留守山东。黄巢的队伍转战于浙闽间。此时，南方爆发瘟疫，义军死伤无数，再加上官军四处围剿，黄巢差点丧命，于是又改变计划，从桂州渡江，沿湘江而下，一路上免不了与官军相遇，大小数十战，，互有死伤。
在此期间，朱温受到了一次致命的打击，既不是在战场上的失败，更不是在情场上的失意，而是与自己相依为命多年的二哥朱存战死了。
这可就像要了朱温的命啊。你想，朱温从小丧父，而在古代兄长如父母，自己的二哥从小都很关心自己，何况在军队里，二哥是自己的唯一亲人，现在这战死了，谁还关心自己？
只有自己强大起来，才能不被人欺负，于是朱温奋勇杀敌，为的就是能在军队里立稳脚跟。
黄巢由湘南渡过淮河向西，召集山东等地的义军，攻下东都洛阳，随即进入潼关。
潼关位于陕西省渭南市潼关县北，北临黄河，南踞山腰。《水经注》载：“河在关内南流潼激关山，因谓之潼关。”始建于东汉建安元年（196年）。潼关是关中的东大门，历来为兵家必争之地。潼关失守，长安难保。
不久，黄巢就攻下了长安城, 唐僖宗像他的父辈唐玄宗一样慌忙出逃四川。
先不管其他，为什么唐朝的皇帝每次发生内乱时，首先选择蜀地作为逃亡地呢？我看是就近原则。长安离四川很近，何况又有天险，沃野千里，不愁吃不愁穿的。
其实早在楚汉相争时，刘邦躲进蜀地也差不多就是如此。
攻下长安后，黄巢建立了政权，号称大齐皇帝，改年号为金统。此次战役，朱温功不可没，于是黄巢命他驻扎在东渭桥，防御官军的进攻；随后任命他为东南面行营先锋，攻下南阳和同州。
至此，朱温有了自己的本钱---军队。
如果一个地方军阀只有军队没有虎将，想要在强食弱肉的时代继续存在下去，那是很难的。
朱温也意识到这一点，在追随黄巢南征北战的过程中，他很注意结交朋友，很多后来都成了他的得力助手，如：硃珍、庞师古、张存敬等。他们都成为了后梁的建国功勋。
据野史记载，朱温曾建议黄巢攻打宋州，目的是想早点得到宋州刺史张蕤的女儿。谁知张蕤早已离任，接任的刺史又有些本事，朱温久攻不下，大失所望，只得退兵。
