在进占贝鲁特西区时，以军遭到巴解游击队的零星抵抗，给以军造成了一些人员和装备损失。时任以色列国防部部长的沙龙下达命令：立刻采取“断然措施”。之后以军包围了萨布拉和夏蒂拉两个难民营。
以色列考虑到难民营中已经没有抵抗力量，于是，决定借黎巴嫩基督教长枪党之手来完成这次屠杀。1982年9月16日，以色列的国防部长沙龙下达指令，几架以军的直升机飞临难民营上空，投掷下一连串的照明弹。同时，大批长枪党民兵持枪冲进了难民营。
以色列军队用大炮和照明弹配合着歹徒。这次大屠杀持续了一夜，难民营成了人间地狱。很多被发现的尸体损毁严重。许多男孩遭到了..，一些人的头皮被剥了下来，有些尸体上被刻上了十字架，甚至连婴儿也没逃过毒手。
屠杀进行了一夜，一些幸存者回忆道：“16日那一夜，这里简直是一座地狱，天空始终没有黑下来，枪声始终没有停过，，人们一直在尖叫。”
之后高层们为了掩人耳目，发出指令：“马上把现场清理干净，不得留下任何痕迹。”他们用挖掘机挖出了一个个大坑，将尸体抛入坑中。
这场屠杀造成的死亡人数至今无法确切统计，有的说1000人，有的说1500人，还有的说遇难者达3000人。
这场屠杀震惊了世界，来自世界各地的口诛笔伐此起彼伏，以色列政府辩解道：我们以为长枪党民兵仅是搜捕巴解游击队员，而没有想到他们会如此不问青红皂白。
1982年12月16日，联合国代表大会谴责了这一屠杀事件并将其定性为种族清洗。并要求当时的国防部长沙龙负责，沙龙被迫辞职（沙龙后来成为了以色列总理）。
一个曾经的屠杀受害者，几十年后却扬起屠刀，所作所为跟当年的纳粹德国没有什么两样，实在是讽刺。
