印加军队没能找到曼科带领群众逃去了哪里，只好气愤地把他们找到的入口糊起来，整修成了一座印加神庙。(而神庙内部其实是玛雅的建筑风格)
到这里就是帕依提提的建立和发展过程。14世纪，哥伦布发现了新大陆，后续西班牙入侵者的四处征服与掠夺，也开始影响到了帕依提提。
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公元16世纪末——在殖民地“遗失的黄金国”的诸多传言中，罗马教会收集到了关于帕依提提守护的某件神器的消息，据说这件神器可以“重塑世界”。罗马教会背后的圣三一很快查清楚了帕依提提的位置，派遣两名圣三一高阶传教士与一众军队前往帕依提提取得圣物。
值得注意的是，通往隐秘之城的路并不只有劳拉妹荡秋千飞过的那一条，也有一条安全的水路可以直接从库阿克雅库驶向帕依提提，也就是约拿自己找着的那条路，，劳拉妹后来通行来往于此也都是走这条水路。过去也有商人通过这条水路来到帕依提提，应该也有殖民者坐船而来。
1603年11月24日——圣三一传教士塞拉诺与诺佩兹照着圣三一给的线路走，轻松到达了隐秘之城，受到了当地居民警戒的迎接。
11月29日，诺佩兹“在上帝的指引下”得知了神器的位置。此时，由殖民者带来的欧洲的传染病也正在帕依提提流行着(美洲原住民没有抗体，被欧洲殖民者带来的各种传染性疾病感染后，有无数部族几乎灭亡。这些可怕的传染病包括天花、黑死病和梅毒)。
11月某日晚，诺佩兹在帕依提提河边与帕依提提大帝碰面，这两个人已经是好友了。诺佩兹将自己的身份和任务和盘托出。二人达成共识，不能让银盒子落入圣三一腐败的领导层之手，诺佩兹会带着银盒子离开帕依提提，找一个安全的地方藏好盒子，在未来，等待帕依提提皇室后人“天选之人”循着他们留下的线索找回盒子。
