就在慈安死亡的那一年，《清稗类钞》中有写到，慈安与慈禧发生了较为激烈的矛盾，主要原因是在慈禧患病期间，慈安代为处理过国事一段时间，这让拥有极强控制力的慈禧非常不满，她生怕慈安会抢走自己的位置，所以脑海里开始有了些不好的想法。后来慈安真的死了，虽然没有确凿证据能够表明是慈禧干的，但众人都觉得只有慈禧才会胆大包天做出这种事情来。
后来溥仪，也就是慈禧养女之子，曾在自己的回忆录中写到，慈禧之所以会杀慈安，是因为她手上握着一道咸丰帝的遗诏。咸丰帝知道慈禧性格跋扈，将来可能会做出一些惊天动地的事情来，所以写下一道遗诏以备不时之需。
遗诏内容是如果慈禧敢意图不轨，就直接绞杀。前面我说过，慈安是比较善良的，她看见慈禧在咸丰帝死后对她也还是毕恭毕敬的，似乎没有越矩的意思，就把遗诏给藏起来了。后来慈禧知道了遗诏的存在，就跟慈安发誓自己绝对会永远忠于本分，慈安心软便把遗诏给烧了。接下来的剧情想必不用说，大家应该也能猜得出来，慈安就这样死了，在溥仪的描述中，，她应该是吃了慈禧送来的汤食后中毒而死的。
不过后来修史的史官们都觉得这只是溥仪的片面之言，或许慈安只是因突发病而死，与慈禧无关。
