从2001年10月7日作战行动开始到美军占领坎大哈（..的基地）两个月的时间里，B-52H和B-1B执行了美军10%的空中攻击任务，投放了11,500枚武器。实际上，B-1B任务架次只占美军飞机架次的5%，却投放了近40%的弹药。
2001年12月，第28轰炸机联队第37中队的B-1B（序列号86-0114）在阿参战期间于印度洋上空坠毁，四名乘员弹射脱离，，这是B-1B第一次战时损失；2013年8月19日，一架B-1B从南达科他州埃尔斯沃思空军基地起飞坠毁在蒙大拿州的一个偏远地区，四名乘员弹射脱离。
