科技创新指数研究力图对创新环境、创新服务、创新融资、创新主体、创新成效等进行系统评估。中小城市科技创新评价指标体系包含四个指标：“双创”..建设、研发潜力、科技创新活力、科技创新成效。
2018年度全国科技创新百强县
1、 江苏昆山市 2、江苏太仓市 3、江苏江阴市
4、 江苏张家港市 5、福建晋江市 6、江苏常熟市
7、 浙江平湖市 8、江苏宜兴市 9、山东龙口市
10、湖南长沙县 11、浙江慈溪市 12、江苏启东市
13、福建福清市 14、浙江瑞安市 15、浙江温岭市
16、浙江诸暨市 17、浙江海宁市 18、江苏海门市
19、江苏丹阳市 20、江苏如皋市 21、山东齐河县
22、浙江余姚市 23、山东广饶县 24、辽宁海城市
25、山东荣成市 26、河北迁安市 27、浙江义乌市
28、山东招远市 29、福建石狮市 30、江苏如东县
31、福建南安市 32、山东滕州市 33、江苏海安市
34、山东新泰市 35、浙江德清县 36、江苏邳州市
37、山东青州市 38、江苏溧阳市 39、江苏扬中市
40、浙江玉环市 41、安徽肥西县 42、山东莱州市
43、浙江嘉善县 44、江西南昌县 45、江苏仪征市
46、山东肥城市 47、河北辛集市 48、河南新郑市
49、山东莱西市50、湖南醴陵市 51、安徽宁国市
52、浙江象山县 53、江苏句容市 54、江苏金湖县
55、湖北大冶市 56、河南巩义市 57、新疆库尔勒市
58、江苏沛县 59、辽宁瓦房店市 60、河南禹州市
61、江苏沭阳县 62、江西贵溪市 63、河南长葛市
64、贵州盘州市 65、山东昌邑市 66、吉林延吉市
67、安徽长丰县 68、河南荥阳市 69、浙江宁海县
70、安徽天长市 71、湖北宜都市 72、江苏新沂市
73、贵州仁怀市 74、安徽肥东县 75、福建惠安县
76、山东禹城市 77、安徽当涂县 78、江苏建湖县
79、山东庆云县 80、福建安溪县 81、河南永城市
82、广东四会市 83、河北任丘市 84、山东桓台市
85、浙江龙游县 86、江苏睢宁县 87、内蒙古准格尔旗
88、河北香河县 89、安徽巢湖市 90、河北滦州市
91、宁夏灵武市 92、吉林通化县 93、山西孝义市
94、江苏灌云县 95、河北定州市 96、海南琼海市
97、河北固安县 98、陕西韩城市 99、山东沂水县
100、湖北枣阳市
2018年，中小城市科技创新指数为58.4，在科研成果产出和转化方面的作用还亟待提升。分区域看，，东部、中部、西部和东北科技创新指数分别为65.4、56.3、52.5和52.4，区域之间的科技创新能力差距比较大。
