如果说赛制的更改是第一个争议点，那么节目中出现的不少播出问题也为人诟病。字幕更新不及时，《宠爱》一组的演出甚至出现声画脱轨的现象。虽然节目组第一时间做出了道歉并承诺会尽快更改，但在评论区能够看到观众的怨气。
创造101第3期非议不断，选手跑路连累Sunnee，吴宣仪失败竟因太美
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播出时令许多人惊讶的是，人气选手Sunnee在节目一开始被选为C位，但是在节目正式表演的时候表演的C位变成了李子璇，并且到Sunnee唱歌的部分个人镜头全无。相同情况同样出现在Sunnee同个公司的选手身上，这样神剪辑是节目组的问题吗？
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