现代科学家的古埃及人仍然是一个很大的谜团。大多数埃及学家认为他们来自亚洲，理由是属于闪米特族的古埃及语言。埃及祖先研究人员的一小部分发现在“黑色”非洲。
必须说的是，古埃及的居民们自己也混淆了科学家，他们用不同的肤色描绘自己 - 从浅棕色到几乎黑色。希罗多德比较埃及人，埃塞俄比亚人和科尔阡人，认为它们都是相互关联的，因为它们的特征是黑皮肤和卷曲的头发。
人们只能假设，古埃及，是千百年来“大熔炉”对于许多文化和民族，没有留下一个同质族群，也许老王，谁保持了他们的血液纯度的后裔除外。几个世纪以来，在埃及，包括亚述人，利比亚人，库什特人，波斯人，，希腊人，罗马人，..人，土耳其人在内的许多民族“被遗传”。
不久前，马克斯普朗克研究所的德国遗传学家决定检查亚历山大大帝征服埃及或其他国家和人民的代表是否存在遗传痕迹。对于这项研究，采集了90个木乃伊的线粒体基因组，涵盖了一千多年的时间。
科学家已经确定，正在调查的遗传物质没有经历重大的遗传变化。尽管来自欧洲，中东和非洲的一些移民潮，人口的遗传特征保持稳定。但重要的是要考虑到，这只有在涉及所研究的木乃伊所属的较高等级的代表的情况下才是真实的。
同样来自德国，科学家们发现，如果现代埃及人都生活在撒哈拉以南非洲地区的非洲国家有遗传关系，古埃及的居民的样本显示与中东和地中海东部地区的人口遗传共性。非洲内陆地区的人涌入大约1300年前，加上..征服埃及造成的奴隶贸易和移民浪潮的增加。
目前，古埃及人的直系后裔被认为是科普特人 - 埃及的基督教人口，不超过该国总人口的7％。尽管科普特人和..人属于不同的民族，但几乎不可能将他们与外部区分开来。
