连日来，东航在日营业部源源不断地将各个机场的最新情况发回上海总部，东航特别成立大阪、札幌机场关闭应对工作组，综合天气、机场重新开放时间等各个因素动态调整决策，每日更新运行动态。由于大阪机场航班停运，大部分旅客就近改至名古屋中部机场。9月6日，东航迅速研究制定临时加班航班计划和机型放大计划。东航把原来执行任务的A320小机型换成A330大机型，平均每个航班能够多拉130人左右，通过这种方式，以最快的速度运送滞留旅客回国。
根据东航9月7日的运行决策，9月11日（含）以前的大阪航班都已取消，，9月7日至11日，增加13班上海、北京等地往返名古屋的加班航班；国内飞往名古屋、冈山的正班航班共计36个航班临时换大机型执行。另外，9月8日开始札幌机场重新开放，东航正班航班MU279/280（浦东-札幌-浦东）临时更换为A330大机型来执行，当天还有一半补班航班MU279D/280D从浦东飞往札幌接运旅客。
根据最新消息，9月7日当天，因此次台风和地震影响，东航头3班赴日的临时加班航班已经顺利执行完毕。三个航班几乎是“空机”飞往..的，回程MU7078（名古屋-浦东）航班搭载127名滞留旅客于当天15:16分抵达浦东，第二架MU7080（名古屋-浦东）航班搭载89名旅客于16:05安全抵达。第三架执行MU7088航班于18:10分抵达北京首都机场。
9月8日的札幌机场国际候机楼里已是人山人海，东航浦东飞往札幌的MU279航班已于上午8时46分起飞。
