这些犹豫不决的官员开始有了动作，御史杨维垣也激烈地弹劾了崔呈秀。见弹劾的官员多了，崇祯帝顺势批准了崔呈秀的请辞信。
皇帝作出的这个举动，越发地表明了自己的态度，那就是：他不支持魏忠贤！开始有人大胆地弹劾魏忠贤。一旦有人开了头，附合的人越来越多了，魏忠贤当然感到压力巨大，后来终于顶不住了，向皇帝提出告病回乡的辞呈，接着，皇帝批准了他的请辞，免去他的官职，把他派到凤阳看守祖陵。皇帝的这个决定颁布后，并没有人闹事，于是他干脆要拿魏忠贤治罪，在途中，魏忠贤知道自己死罪难逃，自杀身亡。
魏忠贤一个老谋深算的人，为什么会败给一个年纪轻轻的皇帝？其实归根究柢有几个原因：
一是他掌权时间太短，天启帝只在位七年，前五年魏忠贤没有掌权，后两年的时间不够建立一个稳固的势力。
二是制度问题，当时朝廷的权力机制是靠票拟和批红，内阁管票拟的事，而批红有时候是给皇帝，有时候是给太监，如果皇帝要收回来批红的权力，太监哪里有资格不同意？所以他也找不到反对的理由。
再一个原因，也是魏忠贤比较胆小，不敢去冒险，他只想不动刀枪就能过舒服日子，所以皇帝逼他的时候，他也不敢反抗，正因为如此，他才会败在一个十七岁的年轻人手中。
