明朝历史上有四大疑案:建文疑案、梃击疑案、红丸疑案、移宫疑案，这四大疑案中除了建文疑案发生在明初，其余三个皆发生在明朝晚期。
一、建文疑案:
建文四年，燕王朱棣率燕军攻破京师，城破之时皇宫发生大火，被发现的两具烧焦的尸体被认为是马皇后和太子朱文圭，而建文帝却不知所踪。关于建文帝的下落有多种说法，，有说建文帝烧死了，也有说建文帝从密道逃跑后出家了，还有说建文帝逃到海外了。总之建文帝最终在哪里，六百年来始终没有定论，活不见人，死不见尸。这也是明朝第一大疑案。
二、梃击疑案:
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