关于隋文帝杨坚的死因，目前世人有两种说法：
第一种：认为他是死于其子杨广手中，即是死于谋杀，这也就是盛传的隋炀帝杨广弑父..案。
史书记载：隋文帝晚年病重之际，尚书仆射杨素、兵部尚书柳述等奉旨入宫侍驾，太子杨广也于此刻入住大兴殿，但没让他侍奉文帝。为了了解父皇的病情进展情况，杨广就写信给杨素让其密切关注病情变化，并询问一旦文帝驾崩之后的具体处理办法。杨素写好回信后，送信的侍从却将信送到了隋文帝手中，文帝看后非常震怒，开始对太子杨广有了看法。
接着不久，就发生了太子杨广调戏母后陈夫人之事。马总《通历》云：“上有疾，于仁寿殿与百僚辞决，并握手歔欷。是时唯太子及陈宣华夫人侍疾，太子无礼，宣华诉之。帝怒曰：‘死狗，那可付后事！’邃令召勇。杨素秘不宣，乃屏左右，令张衡人拉帝，血溅屏风，冤痛之声闻于外，崩。”可见，由于杨广非礼母后，文帝怒而欲废黜之，杨广怕帝位不保，先下手为强，杀了隋文帝。
第二种：认为隋文帝是因病而亡的。
据《隋书·高祖纪》对文帝驾崩的记载情况来看，仁寿四年（604年）四月，文帝患病于仁寿官，六月六日，病情加重，文帝宣令大赦天下，以求百姓祝福，上天祝福。当时的天象是，“有星入月中，数日而退”，这是一种不祥之兆。果然，不几天，“上以疾甚，卧于仁寿宫，与百僚辞决，并握手歔欷”。十三日，史载文帝“崩于大宝殿”，时年64岁。
