为保持婴儿健康、不被细菌感染，必须彻底清洁婴儿奶瓶用奶嘴。首次使用奶瓶前，务必对新购买的奶瓶、奶嘴进行灭菌（沸水中浸泡约几分钟即可）。使用后的清洗看似简单，其实事关婴儿安全问题，特别是奶嘴，因为奶嘴有细孔，会截留牛奶，牛奶营业丰富，会滋生微生物，也就是细菌。可以参考以下方法清洗：
一、含氯水清洗
1、可以戴上橡皮洗碗手套来保护手。自来水烧热后装盆里。大多数城市的供水中都含有氯，氯能杀死细菌。
2、往热水里加一点皂液或洗洁精。将奶嘴放置在热水中，并使其浸泡10分钟。
3、使用刷子（牙刷也可以）刷洗奶嘴以清除残留的牛奶。用热的肥皂水灌满奶瓶，挤压奶嘴使水通过孔挤出，以冲洗掉任何可能截留的牛奶。
4、将奶嘴内翻，重复清洗过程。再次，用热的肥皂水灌满奶瓶，挤压奶嘴使水通过孔挤出，以冲洗任何截留的牛奶残渣。
5、然后用温水冲洗奶嘴，去除所有皂液及其他消毒水残留物。将奶嘴干燥后放置在橱柜中；干燥可以是风干，但是彻底干燥前不要放置于密闭的橱柜中，因为潮湿的奶嘴容易受细菌感染。
二、不含氯的水清洗，比如纯净水、家用净水器的水
如果家里水龙头都按照有净水装置，出水可能不含氯，或者含氯量很低，已经不能提供杀菌作用，这时，除了上述热水清洗是不够的，因为人手耐受的水温有限，一般都达不到80度。这时，还需要将奶嘴放在容器中煮沸约15分钟或85度左右30分钟以上（类似食品巴氏杀菌），以杀灭细菌。
三、洗碗机清洗
如果用洗碗机，将奶瓶嘴放在支架上，以便更好地完成清洗的循环过程。洗碗机中的热水应足够热，以提供足够的消毒。
不论哪种清洗方法，都必须使奶嘴尽快干燥，可以风干或消毒柜烘干。没有彻底干燥前，不要将奶嘴置于密闭空间，因为湿的奶嘴更可能促进霉菌生长。
我国国家标准GB5749《生活饮用水卫生标准》中对于来水余氯含量的指标是管网末梢：0.05mg/L；因为自来水厂都有加入次氯酸钠消毒剂消毒水源。必要的氯残留可以抑制自来水微生物的滋生和繁殖。虽然自来水含有氯气味道，不好闻，很多家庭不用自来水泡茶是可以理解的，但是洗涤用水，包括洗菜、洗碗、洗锅，还是尽量用自来水，比纯净水更安全。
含氯消毒剂十分常见，最常见的用途包括自来水厂、食品厂车间员工手部、工器具的消毒、还有公共场所的消毒，比如84消毒液。当然酒精也可以消毒，但是酒精消毒浓度高，是75%的酒精，主要用于食品厂员工手部消毒和医院。
