在这次事件中，恭亲王奕訢是当之无愧的头号功臣。此后，他的地位在清朝急剧上升，甚至有时候还要压慈禧一头。奕訢出任的是军机处首领大臣，军机处几乎都是他的人，慈禧在1861年（这是甲申年），以当时的清法战争失利为理由，将奕訢等军机处成员全部罢黜。换了另一套能力弱，但完全服从于自己的班子来管理军机处。这就是“甲申易枢”，之后的清朝几乎已经完全被慈禧所掌握了。
慈禧最后一次政变，是戊戌政变。戊戌政变发生在戊戌变法之后，当时光绪和慈禧已经有了明显的矛盾，但是光绪并没有掌握实权，他在皇宫中越来越感觉自己非常危险，于是他就给杨锐写了一封衣带诏，说自己皇位不保，请康有为等人速去营救他。
谭嗣同于是就找到了袁世凯，希望袁世凯能够出兵“清君侧”。但是这个老狐狸袁世凯显然更加支持慈禧，他偷偷跑去北京，向慈禧告了密，结果导致康有为他们之前所有的计划全部落空了，光绪皇帝也因此软禁了起来，戊戌六君子英勇就义，康有为梁启超等人出逃海外。
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