洪武三十一年，朱允炆即位之年，便已对制度予以更定。裁五军都督府断事官、大理寺复设均在本年九月完成：
九月二十日，革五军都督府断事官。是日复设大理寺。
不过，这两项改革，并不是建文改制的主要内容。建文元年二月，寿州训导刘亨上书，拉开了建文改制的序幕：
更定官制。先是，寿州训导刘亨应求直言。上言：文武并用，久长之术。六卿秩卑于五府，非所以示均隆，……已，与孝孺等议，乃大加更定。
案刘亨本一级别甚低之地方教官，他突然应诏进言，朱允炆也迅速接受，所言又颇合朱允炆心意，后又多照此施行。可知刘亨之上言，决不同于一般的应诏言事。高层政治行动，端赖低级官员襄赞，此为中国政治传统之一。即在明代，张璁桂萼之议礼，邹应龙之劾严嵩，均为显例。
笔者推测，朱允炆、方孝孺暗中指使刘亨上言，藉以坐收顺水推舟推进改制。刘亨所言注重文武之别，并不言及制度合理化之要求，以及改制背后之政治理想。这表明：朱允炆、方孝孺一开始便意欲得到士大夫集团的支持以推进这场改革。不过，上书中流露的右文贬武倾向，足令武臣寒心，不啻减弱了统治的拥戴力量，给建文政局埋下隐忧。
刘亨二月上书，建文改制即已正式登场。建文元年的二、三、四月，可谓是朝廷改制的第一个..：改户部、刑部为四司；六部品秩升至正一品；布政使升至正二品；堂上官进秩一级；调整都察院、大理寺、太常寺、鸿胪寺、通政司等中央官。
建文元年的这些改制，几乎是与削藩同步进行的，齐、湘、岷三王便削于建文元年的上半年。七月朱棣起兵造反，朝廷改制便已成为他攻击的口实。
建文朝廷边打边改制，主要精力在改制
建文二年构成建文改制的又一个..。年初朝廷颁布《皇明典礼》，于皇室礼文详加勘定，东宫、王府官制均亦改定。无疑的，这是朝廷鉴于朱棣造反，而不得不于皇室家族之间的程式、规范重加参订，以适应新形势，并以此谋求皇室内部之敦睦。
